Molekyler er ikke statiske, men bevæger sig og åbner og lukker sig – lidt a la 80’ernes pacmanspil. Deres struktur og bevægelsesmønstre har betydning for, hvordan de vekselvirker med andre molekyler. Derfor er forskerne interesserede i at kunne beskrive dem.
Det enkelte molekyle giver ny viden
“Hvis vi kan se og karakterisere det enkelte molekyle og se hvordan det vekselvirker med de andre molekyler, kan vi forstå hvad der sker i den enkelte begivenhed. Når vi forstår mekanismerne bag, kan vi begynde at arbejde med at kontrollere hvordan molekylerne virker, så det sker på de mest gunstige tidspunkter”, siger lektor Victoria Birkedal, der forsker i forståelsen af det enkelte molekyle på iNANO på Aarhus Universitet.
Let adgang til bedre data
Victoria Birkedals forskningsgruppe har udviklet en ny software, der gør det langt lettere at få hurtige og præcise data efter en smFanalyse. Gruppen har netop fået publiceret en artikel om softwaren i det anerkendte tidskrift Nature Methods.
Softwaren giver lettere adgang til data der ellers har været tids- og arbejdskrævende at få. Hidtil har kun få specialister kunne lave databehandlingen. Med programmet bliver det tilgængeligt for en bred kreds af forskere.
Fra plet til struktur
“Førhen lavede vi dataanalyser natten over uden helt at vide om de gav de ønskede resultat. Programmet er så hurtigt, at vi nu har resultater i løbet af få minutter”, fortæller Victoria Birkedal. Programmet giver en innovativ visuel tilgang til data, og gør forskerene i stand til at lave hurtigere og mere præcise data analyse. Det giver grafisk støtte til at se det enkelte molekyle og analysere hvordan det opfører sig. Det kan bruges til al forskning i det enkelte molekyle, men Aarhus-gruppen bruger det til at se på biologiske processer i kroppen.
“Et molekyle er meget, meget lille. Men nu er det ikke bare en plet. Vi kan se dets struktur og hvordan det opfører sig og prøve at forstå, hvorfor det gør som det gør”, siger Victoria Birkedal.
Næste skridt er at kontrollere molekylets struktur, så man kan få det til at opføre sig på bestemte måde – noget der kan bruges i målrettet medicin.
Demokratisk software
Gruppen har valgt at lade softwaren være tilgængelig for alle. “Vi ønsker at demokratisere adgangen til data”, siger Victoria Birkedal, der glæder sig over at softwaren åbner for lettere muligheder for at arbejde sammen på lang afstand. Programmet er blevet godt modtaget de steder det er blevet præsenteret.
